近日，小编接到纳税人咨询这样一个问题，“我公司与a公司在合同执行过程中发生了经济纠纷，对方虽然将增值税专用发票开具但一直未交付给我公司。近日，合同纠纷已经解决但我公司发现a公司开具的增值税专用发票已经超过了认证抵扣时限。那么，这样的增值税专用发票还可以抵扣吗？如果可以，具体该如何操作呢？”
各位纳税人，在实务中您是否也遇到过类似问题呢？别急，接下来小编就给您讲讲关于增值税扣税凭证逾期能否继续抵扣的相关问题。
根据《国家税务总局关于进一步明确营改增有关征管问题的公告》（国家税务总局公告2017年第11号）第十条规定：
“自2017年7月1日起，增值税一般纳税人取得的2017年7月1日及以后开具的增值税专用发票和机动车销售统一发票，应自开具之日起360日内认证或登录增值税发票选择确认平台进行确认，并在规定的纳税申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
增值税一般纳税人取得的2017年7月1日及以后开具的海关进口增值税专用缴款书，应自开具之日起360日内向主管税务机关报送《海关完税凭证抵扣清单》，申请稽核比对。”
根据《国家税务总局关于进一步优化增值税、消费税有关涉税事项办理程序的公告》（国家税务总局公告2017年第36号）第一条规定：
“自2018年1月1日起，逾期增值税扣税凭证继续抵扣事项由省税务局核准。允许继续抵扣的客观原因类型及报送资料等要求，按照修改后的《国家税务总局关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告》（国家税务总局公告2011年第50号）执行。”
根据修改后的《国家税务总局关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告》相关规定：
“增值税一般纳税人发生真实交易但由于客观原因造成增值税扣税凭证（包括增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书和机动车销售统一发票）未能按照规定期限办理认证、确认或者稽核比对的，经主管税务机关核实、逐级上报，由省税务局认证并稽核比对后，对比对相符的增值税扣税凭证，允许纳税人继续抵扣其进项税额。
客观原因包括如下类型：
（一）因自然灾害、社会突发事件等不可抗力因素造成增值税扣税凭证逾期；
（二）增值税扣税凭证被盗、抢，或者因邮寄丢失、误递导致逾期；
（三）有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，纳税人不能正常履行申报义务，或者税务机关信息系统、网络故障，未能及时处理纳税人网上认证数据等导致增值税扣税凭证逾期；
（四）买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证，或者纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期；
（五）由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期；
（六）国家税务总局规定的其他情形。”
根据修改后的《国家税务总局关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告》附件《逾期增值税扣税凭证抵扣管理办法》相关规定，纳税人申请办理逾期抵扣时，应报送如下资料：
（一）《逾期增值税扣税凭证抵扣申请单》。
（二）增值税扣税凭证逾期情况说明。
纳税人应详细说明未能按期办理认证、确认或者稽核比对的原因，并加盖企业公章。其中，对客观原因不涉及第三方的，纳税人应说明的情况具体为：
1.发生自然灾害、社会突发事件等不可抗力原因的，纳税人应详细说明自然灾害或者社会突发事件发生的时间、影响地区、对纳税人生产经营的实际影响等；
2.纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期的，纳税人应详细说明办理搬迁时间、注销旧户和注册新户的时间、搬出及搬入地点等；
3.企业办税人员擅自离职，未办理交接手续的，纳税人应详细说明事情经过、办税人员姓名、离职时间等，并提供解除劳动关系合同及企业内部相关处理决定。
（三）客观原因涉及第三方的，应提供第三方证明或说明。具体为：
1.企业办税人员伤亡或者突发危重疾病的，应提供公安机关、交通管理部门或者医院证明；
2.有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，导致纳税人不能正常履行申报义务的，应提供相关司法、行政机关证明；
3.增值税扣税凭证被盗、抢的，应提供公安机关证明；
4.买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证的，应提供卖方出具的情况说明；
5.邮寄丢失或者误递导致增值税扣税凭证逾期的，应提供邮政单位出具的说明。
（四）逾期增值税扣税凭证电子信息。
（五）逾期增值税扣税凭证复印件（复印件必须整洁、清晰，在凭证备注栏注明“与原件一致”并加盖企业公章，增值税专用发票复印件必须裁剪成与原票大小一致）。
编辑设计：云南税务
来源：中税答疑新媒体智库